Địa bàn xã Hương Xuân hiện nay trước đây vốn là hai xã Hương Giang và Hương Hòa thuộc huyện Nam Đông.

Xã Hương Hòa được thành lập vào ngày 17 tháng 3 năm 1997 trên cơ sở 1.040 ha diện tích tự nhiên và 1.891 người của xã Hương Lộc.[3]

Trước khi sáp nhập, xã Hương Giang có diện tích 7,64 km², dân số là 1.512 người, mật độ dân số đạt 198 người/km². Xã Hương Hoà có diện tích 11,21 km², dân số là 2.547 người, mật độ dân số đạt 227 người/km².

Ngày 17 tháng 12 năm 2019, Ủy ban Thường vụ Quốc hội ban hành Nghị quyết 834/NQ-UBTVQH14 về việc sắp xếp các đơn vị hành chính cấp xã thuộc tỉnh Thừa Thiên Huế (nghị quyết có hiệu lực từ ngày 1 tháng 1 năm 2020)[1]. Theo đó, sáp nhập toàn bộ diện tích và dân số của hai xã Hương Giang và Hương Hòa thành xã Hương Xuân.